D75, Ещё возможно, что пенопластовый органайзер (над запаской) постукивает. Он же из двух частей состоит, если мне память не изменяет, так вот верхняя (центральная) часть может побрякивать. Можно попробовать в места стыков (достаточно в одном любом месте) тряпку подсунуть, так сказать зафиксировать.
Так же, у правой стенки есть эдакий бокс, он закрывается пластиковой пластиной на защёлки. Может быть не все защёлки защёлкнуты
Ну и конечно же, можно проверить обшивку пятой двери, обстучать её. А может быть всё-таки полка багажника не плотно прижимается пятой дверью? На полке есть такие резиновые упоры на лицевом торце, они могут не касаться двери в закрытом состоянии.